馬來西亞理科大學優勢學科有多媒體計算、網絡計算、軟件工程、智能系統、數學、數學模型、應用統計學、數學與經濟學、特殊教育、學前教育、城市與區域規劃、建筑學、室內設計、建筑技術、建筑管理等專業。馬來西亞理科大學USM在51類細分學科中有21類優勢學科排名進入TOP300。USM的學科建設發展均衡，21類優勢學科全面涉及五大學術領域。
優勢專業
藥劑及藥理學專業
馬來西亞理科大學藥學院，提供藥物化學、制藥技術、藥理學、生理學、臨床藥學以及社會和管理藥學等多門，在2021年QS世界大學學科排名當中藥劑與藥理學專業排名當中位列第75位。
建筑學及建筑環境專業
馬來西亞理科大學住房、建筑和規劃學院是馬來西亞理科大學的熱門學院之一，學院開設了建筑、室內設計、建筑測量、建筑技術、施工管理、城市和區域規劃以及工料測量七個本科課程，并獲得了各個專業學科機構的認證。例如：馬來西亞建筑師學會、馬來西亞建筑師委員會、馬來西亞皇家測量師學會、英國皇家特許測量師學會、亞太區工料測量師協會和馬來西亞規劃師學會。
除此之外住房、建筑和規劃學院還提供碩士和博士學位的課程和研究，研究方向寬廣，涵蓋建筑技術、城市規劃、項目管理、建筑、景觀建筑、室內設計、住房和工料測量八大領域。在202QS世界大學學科排名當中建筑學和建筑環境專業排名第101位。
馬來西亞理科大學
是馬來西亞政府建立的第二所公立大學，成立于1969年7月。校園規模龐大、環境優美，被譽為亞洲的花園大學。共有3個校區組成，主校區(也叫Minden校區)和工程學校區分別位于檳城島和檳城的大陸部分，第3個校區是醫學院、牙科和保健學院，位于馬來西亞東部海岸的吉蘭丹。在第9個馬來西亞國家計劃中，大學還將在學校附近建立研究院，其中分子醫學研究所是2005年首批建造的研究所之一。
2005年6月29日，理科大學被聯合國大學指定為可持續發展專業技術教育的區域中心，成為繼日本、加拿大、西班牙、太平洋島國家、荷蘭和德國等中心外的全球第7個區域中心。
正是因為其卓越的教學和科研水平，理科大學在國內外享有非常高的聲譽，在2004年泰晤士高等教育增刊對全世界大學所做得的綜合排名中，理科大學在全球大學排名中位居111位，亞洲排名第15位，東盟國家排名第4位。
